吉木薩爾縣位於新疆維吾爾自治區天山北麓東端，准噶爾盆地東南緣，東經88°30′－89°30′，北緯43°30′－45°，東鄰奇台縣，西與阜康市接壤，北越卡拉麥里嶺和富蘊縣相連，南以博格達山分水嶺同吐魯番地區、烏魯木齊市為界。縣城吉木薩爾鎮。全縣總面積8848平方公里，下轄5鄉4鎮，206個行政村。縣城西距自治區首府烏魯木齊市160公里，距昌吉回族自治州首府昌吉市206公里。全縣總面積8848平方公里，下轄3鄉6鎮，206個行政村，境內有新疆生產建設兵團 農六師2個團場，有漢族、回族、哈薩克族、維吾爾族、蒙古族等13個民族，總人口13.2萬人，其中少數民族人口佔29。2001年被國務院批准為對外開放縣，榮獲科技進步好縣、科普示範縣、自治區歷史文化名城、自治區園林縣城、自治區婚育新風進萬家活動好縣，北庭西大寺被評為民族團結教育基地，有16個單位獲得自治區級以上表彰。2011年地區生產總值39億元，同比增長（下同）20.8；固定資產投資120億元，增長400；完成地方財政一般預算收入4.75億元，增長64.3。 地勢南北高、中間低，地貌可分為南部山區、中部平原、北部沙漠三種類型。主要河流有二工河、西大龍口河、渭戶溝河、白楊河等。屬溫帶大陸性氣候，冬季長而嚴寒，夏季短而炎熱，春秋季節不明顯，乾旱少雨，晝夜溫差大。
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